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長江三峽工程生態與環境監測系統是針對三峽工程可能引起的生態環境問題而建立的跨地區、跨部門、多學科、綜合性和研究性的監測網絡,自1996年建立以來,監測系統按照規定的監測指標體系和操作規范,對三峽生態環境進行全過程跟蹤監測,取得了大量生態與環境數據及資料,為三峽生態與環境的監測與保護發揮了重要作用,為我國大型江河湖泊的綜合性生態環境監測工作做出了積極探索和有益嘗試。隨著水庫逐步轉入正式運行期,三峽監測系統的監測重點也由為工程建設服務轉向為工程運行服務階段。通過對三峽工程監測系統發展至現階段進行總結研究,梳理了三峽工程監測系統的特點、運行成效、示范意義等,最后指出了監測系統今后一個階段內的發展方向。